Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms