Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17577J3QNF7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms