Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc180J3QNE4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms