Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Gm21972J3QN38 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Gm21972J3QN38 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Gm21972J3QN38 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Gm21972J3QN38 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gm21972J3QN38 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gm21972J3QN38 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gm21972J3QN38 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gm21972J3QN38 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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