Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms