Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm6176J3QK59 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6176J3QK59 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6176J3QK59 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm6176J3QK59 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms