Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930544D05RikJ3QK56 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms