Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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