Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim55G3X8Y1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms