Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Srp72F8VQC1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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