Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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