Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm8005F6YKY3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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