Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10378F6XQQ1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms