Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm5861F6VCN9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm5861F6VCN9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm5861F6VCN9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm5861F6VCN9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm5861F6VCN9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm5861F6VCN9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm5861F6VCN9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm5861F6VCN9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Gm5861F6VCN9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5861F6VCN9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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