Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms