Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms