Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5407E9Q7Q1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms