Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Urb2E9Q7L1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms