Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdc1E9Q5K9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms