Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ccdc71lE9Q4T4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccdc71lE9Q4T4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ccdc71lE9Q4T4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc71lE9Q4T4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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