Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

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Length 865 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Pde8bE9Q4S1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Pde8bE9Q4S1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Pde8bE9Q4S1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Pde8bE9Q4S1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Pde8bE9Q4S1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Pde8bE9Q4S1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Pde8bE9Q4S1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Pde8bE9Q4S1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Pde8bE9Q4S1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Pde8bE9Q4S1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Pde8bE9Q4S1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pde8bE9Q4S1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms