Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930579F01RikE9Q3L6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930579F01RikE9Q3L6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms