Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep350E9Q309 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cep350E9Q309 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms