Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc1E9Q043 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc1E9Q043 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms