Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gcom1E9PZ54 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms