Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms