Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms