Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms