Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc17E9PVB5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms