Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms