Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms