Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms