Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc5C3VPR6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms