Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clip3B9EHT4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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