Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms