Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms