Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Abcc8B2RUS7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms