Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms