Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf1B2RRD7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms