Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ythdc2B2RR83 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ythdc2B2RR83 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms