Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brpf3B2KF05 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms