Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp40B1B1D3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp40B1B1D3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms