Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NhsB1AV60 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NhsB1AV60 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms