Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Spocd1B1ASB6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms