Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms