Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp4A4UUI3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms