Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms