Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf39A2RT81 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms