Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam43bA2AM80 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam43bA2AM80 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms