Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ambra1A2AH22 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms